Давайте разберем каждое из предложений и выясним, где необходимо поставить запятую.
1) "В палисаднике росли царственные розы и скромные ромашки и пахучая резеда."
В этом предложении перечисляются три однородных члена: "царственные розы", "скромные ромашки" и "пахучая резеда". Между первыми двумя элементами союза "и" нет, поэтому запятая не требуется. Однако перед последним элементом повторяется союз "и", что указывает на необходимость постановки запятой. Исправленный вариант: "В палисаднике росли царственные розы, и скромные ромашки и пахучая резеда."
2) "В ельнике было темно и прохладно."
Здесь два однородных сказуемых "темно" и "прохладно" соединены одиночным союзом "и". Запятая не ставится.
3) "Мы видели несколько деревьев вдали да бегущие по влажной траве тени гонимых ветром туч."
В этом предложении союз "да" соединяет однородные дополнения "несколько деревьев вдали" и "бегущие по влажной траве тени". Запятая перед союзом "да" не ставится, так как он выполняет функцию союза "и" в значении соединения.
4) "Прошел короткий ливень и на улицах запахло маттилой и горькой сладостью каких-то других цветов."
В этом предложении две части соединены союзом "и": "прошел короткий ливень" и "на улицах запахло маттилой и горькой сладостью каких-то других цветов". Это сложносочиненное предложение, и перед союзом "и" требуется запятая. Исправленный вариант: "Прошел короткий ливень, и на улицах запахло маттилой и горькой сладостью каких-то других цветов."
Таким образом, в предложении 4 необходимо поставить одну запятую перед союзом "и".